همه آنها توان بالقوه این سلولهای سوخت هیدروژنی را که تنها حاصل احتراق در آنها اندکی آب است، میستایند.
اما در این میان مشکلی وجود دارد. گرچه هیدروژن در واقع فراوانترین عنصر در جهان است، نمیتوان به سادگی از آن به عنوان سوخت استفاده کرد، زیرا هیدروژن محکم به سایر عناصر به صورت مولکولهای ترکیبی چسبیده است.
هیدروژن خالص اغلب با کاربرد حرارت بالا (که مقدار زیادی انرژی باید صرف آن کرد) بر گاز طبیعی (یعنی یک سوخت فسیلی) و گاهی با حرارت دان بنزین یا زغالسنگ ( که باز هم سوختهای فسیلی هستند) به دست میآید.
از این بدتر اینکه در این فرآیند دیاکسیدکربن آزاد میشود که خود یک گاز گلخانهای است.